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如果没有大气水同地表水之间的不息循环，生物将是很难生存的。所以，水是地球之根本。
地球虽然是由木火土金水五种物质所构成，但“万物禀形非水不育”，所以水是地阴之根本。
水为阴，火为阳；寒为阴，热为阳。相对而言，地球外表是水，其性寒，内里是火，其性热，是“阴中有阳”的结构格局，也就是所谓的“地本阴也，然阴中有阳”之道。
地心也极似太极阴阳图“阴中有阳”的结构特征，即鱼眼。
“阴得阳升而泉源不竭”，显然，这一定是地球内部的阳，外部的阳是不会使其泉源不竭的。
阴中有阳方可泉源不竭！否则为死水一潭。
天地“造化之权，全在水火”。
“万物之生者，亦惟此日也”。
“万物禀形，非水不育”。
日为太阳，是“阳中之阳”，乃为真阳之火；水为太阴，是“阴中之阴”，乃为真阴之水，即太阳真火与太阴真水的上下升降运动有关乎万物的造化，所以应是天地阴阳之根本。
“唯阳中有阴，故天气得以下降”，这个“阳中有阴”一定是来自外部的地之阴气；“阴中有阳，故地气得以上升”，这个“阴中有阳”一定是来自外部的天之阳气，这是“气之升降，天地之更用也”的阴阳双方相互为用的运动原理。
只有相互为用（相互吸引）的升降运动才能使对立的双方链接成为一个有机的整体，从而天地一体，所以“水能升而火能降，一升一降，无有穷已，故生意存焉”。
从整体上看，太阳阳中有阴，地球阴中有阳是太极阴阳图阴阳互根的结构模式；而太阳火之阳气下降于地，地球水之阴气上升于天就是太极阴阳图阴阳互用的运动模式。
前者是结构，为体，后者是功能，为用，符合任何一个事物都有结构与功能的两个方面。
如果以水火论之，则此正是火外明而内暗，水外暗而内明之证。
太阳“阳中有阴”，地球“阴中有阳”符合太极阴阳图阴阳互根的结构模式，其相当于太极阴阳鱼的鱼头和鱼眼。
太阳火之阳气与地球水之阴气上下升降造化万物的运动符合太极阴阳图阴阳互用的运动模式，其相当于太极阴阳鱼的鱼身和鱼尾（少阳和少阴）。
所以，太阳与地球这个阴阳对立统一体或许就是太极阴阳图的真正源头。
所以太极阴阳图原叫“天地自然之图”。
“在天为气，在地成形”，在天为风热湿燥寒五气，在地为木火土金水五形，形气相感而化生万物。
太阳和地球这个阴阳对立统一体既然为天地阴阳关系，就应具备形气关系。
缘何属于地球大气层变化范畴的风热湿燥寒五气为天？因为站在地球上来看，四时的变化主要取决于太阳相对于地球的视运动所引起太阳火的光能和热能对地球表面辐射量的相对变化的结果，即春夏秋冬四时是由于太阳火的强弱变化而产生的。
四时（五季）的相推又使地球的大气层产生了风热湿燥寒五气的变化，所以称五气为天。
气为阳，火是阳气之根本，所以太阳火是五气（天阳）之根本。
只有太阳火强弱的正常变化，才能四时相推，五气顺布。
天为气，地为形，气为阳，形为阴。虽然天是由风热湿燥寒五气构成，但太阳火是五气之根本。
虽然地是由木火土金水五种物质构成，但水是地阴之根本。
地火只是阴中之火，阴中之火为“少阳”而非为太阳。
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太阳火与太阴水是天地形气之根本，所以（天地）阴阳升降，实质上是水火升降，（天地）形气相感，实质上是水火相济。
所以天地“造化之权，全在水火”，是惟太阳火之阳气与太阴水之阴气上下升降而已。
如果阳气不能下降，阴气不能上升，阴阳之气不能相互为用，就不会有天地一体，也就不会有万物的化生，这是外因。
只有阴阳互根互用，内因外因共同作用，才会有万物的化生。
人体也有太极阴阳图。
正所谓:“人身小天地”，“人是小乾坤”，“人道本乎天道”。
即人体也应是天和地的对立统一体，应具有太极阴阳图“阴阳互根”的结构模式和“阴阳互用”的运动模式。这也正是“天人相应”及“善言天者，必有验于人。”
第301章 阴阳命
人曰:“五脏本皆属阴”，又言“五脏之本，本在命门”，就像“地球之本，本在太阳”一样。
命火是一身阳气的根本，而五脏本皆属阴又本于命门，所以命门与五脏应是对立统一的阴阳关系。人们设命门为天，五脏为地。
命门为“元气之所系”，又藏有元精。元气为元精所化生，二者是功能与物质的关系。任何一个事物都有其结构（体）与功能（用）两方面，体阴用阳，结构为阴，功能为阳，体在内，用在外，这两者是一个有机的整体，相辅相成。
命门也不例外。
阴阳是相对而言的，元气为功能属于阳，元精是物质属于阴，二者同属于命门（天）是一个有机的整体。但元气用在外需发布远行，元精体在内需固守舍藏，体阴在内，用阳在外，抽象而言，可以认为这是“阳中有阴”的结构模式。
这与太阳一样，它的外面是光芒万丈的阳气（元气），内里是产生热核反应的物质（元精），太阳没有内里的热核反应（热核反应相当于元精“化生”元气的过程）就不会产生能够温煦到大地的天之阳气（元阳之气），命门没有元精的生化作用（元精“化生”元气的过程就相当于太阳内部的热核反应）就不会产生能够温煦到五脏六腑的元阳之气，二者的道理是一样的。
元气又称之为元阳之气，亦称之为命火，是人体一身阳气之根本，这与太阳火是天之阳气的根本同出一辙。所以命门是人体内的天，符合太极阴阳图“阳中有阴”的结构特征。
金木水火土“五脏本皆属阴”，是组成人体内地的内容，而肾水是五脏之阴的根本。
木火土金水五形之火是地火，所以心火是阴中之火，为阴中之阳。抽象而言，可以认为这是“阴中有阳”的结构模式。
实际上，心火主血脉的功能是推动五脏血液循环的根本动力，如果没有心火主血脉的功能，脏腑就难以产生五脏六腑之精气（阴气），尤其是心火衰竭就会出现肾水不化的临床病症，这是阴中无阳则其寒必极之证。
与地球一样，虽然地球是由木火土金水五种物质组成，但“万物禀形非水不育”，所以水是地阴之根本。
地火是阴中之火，为阴中有阳的结构模式，如果没有地火氤氲这个内部因素，就不会有泉源之温，地水也就会寒凝不化，这与心火衰竭首先表现的是肾水不化的病症相一致，所以可以认为心火是阴中有阳的结构格局，这也是“人道本乎天道”之证。
五脏是人体内的地（阴），所以“五脏本皆属阴”，五脏是一个有机的整体。心火是阴中之火，为地火，是阴中之阳，所以人体内的地（五脏）符合太极阴阳图“阴中有阳”的结构特征。
五脏是形本属阴，所以五脏阴中有阳也可认为是五脏其形质在外，而功能于内，如心主血脉、肾主水、脾主运化、肺主气、肝主津液等，这些水、血液、食糜、气、津液等物质的代谢过程均在脏器内部完成，是“阴中含阳”的格局；命门则不同，其形质（元精）在内，而功能（元气）行于外，其元气元神均至幽至微，杳然不可见，是“阳中含阴”的格局。
太极阴阳图的另一个特征是阴阳相互为用的升降运动，那么命门与五脏也应存在着阴阳相互为用的升降机理。
“五脏本皆属阴”，肾水是阴中之阴，阴中之阴为太阴，所以肾应为太阴之脏。太阴为至盛之阴，所以肾亦称为“至阴之脏”，而位于人体的下极。
命火是阳中之阳，阳中之阳为太阳，所以命门应为太阳之脏。而太阳为“至盛之阳”，所以命门应为至阳之脏，位于人体的上极才是。
命门为至阳之脏而居上，肾为至阴之脏而居下，二者位于人体的两极，成上下对立升降之势以阴阳相互为用，合乎天道。
命火之阳气与肾水之阴气是如何上下升降相互为用？首先得明确命门的部位，实际上《内经》的“命门者，目也”就是指命门的部位所在，即“睛明所夹之处，是为脑心，乃至命之处，故曰命门”。
脑髓有间脑与大脑先后天之区分，两睛明目系所夹之处正是脑髓的中心，脑髓的中心是间脑，所以人们所指的脑心就是间脑。
人类胚胎早期，脑心的侧壁外突，形成视目系，即《内经》的目睛命门与脑心在发生学上就有着渊源关系。目是脑心的门户，脑心是《内经》的命门所藏纳的先天之精，是生命之根本。
命门通过目系与脑心相联通，二者是生命之门与生命之室的关系，门与室是一体的，目系只是通道。生命之门就是储藏生命物质的地方，生命之室（泥丸宫）就是脑心元精元神所舍藏之处。
脑心就是位于脑髓中央形似泥丸的间脑，间脑主宰着五脏六腑的生理活动，体现着元神的作用，是人体最重要、最核心的生命中枢，去掉大脑皮层生命尚可存在（植物状态），去掉脑心生命不复存在。
脑心是人体最至关重要的生命物质，它就是目睛命门所藏的先天之精，亦即元精。
目睛命门因藏有脑心这个先天之精而具有非常重要的地位，所以《内经》指出目就是命门，是藏有脑心这个非常重要物质的生命之门。
脑髓有间脑与大脑先后天之区分。大脑有思有虑主宰着躯体视听言行之心理活动，属于后天识神；间脑形似泥丸位于整个脑髓的中心，称之为脑心，脑心无思无虑主宰着五脏六腑内脏的生理活动，属于先天元神。
睛明所夹之处是为脑心，两睛明目系交叉像把钳子夹着脑心。脑心就是目睛命门所藏的先天之精。
间脑形似泥丸是整个脑髓的脑心。人类胚胎早期间脑的侧壁外突形成视目系（命门），目睛命门通过目系与脑心相联通，其有着发生学上的渊源关系。
足太阳之脉起于目睛命门，正应之“足太阳之脉，起于目内眦”，其必起源于脑心，这是由其发生学上的关系所决定的。
脑心元精化生的元气随起源于脑心泥丸宫生命之室的足太阳经运行通过目系出生命之门目，即所谓的:“气出于脑”“阳气出于目......循项下足太阳”，然后上额循项下入五脏六腑之俞，最后植入足少阴肾经的至**，并唯肾而络，以命门天火之阳气温煦人体内的地（五脏），这还是命门为“五脏六腑之本”和“其气与肾通”的经络学证据。
五脏六腑之精气皆上注于目睛命门，就必上属于脑心，这也是由其发生学上的渊源关系所决定的。
这就是太极阴阳图“天之阳气下降于地，地之阴气上升于天”在人体内阴阳相互为用的升降运动。
《内经》曰:“人始生，先成精，精成而脑髓生”。
人生先成之精就是先天之精，脑髓就是由先天之精而构成。但是脑髓有间脑和大脑先后天之分，大脑是间脑的自然延伸，是低级脑部位，间脑是脑髓的核心，是高级脑部位，所以“精成而脑髓生”本质上应该是“精成而脑心（间脑）生”，脑心是由先天之精凝聚而成！再合参“命门者，目也”及目与脑心在发生学上的渊源关系，所以脑心就是生命之门目所藏的先天之精！
命门藏先天之精是它最基本的功能，所以《内经》的这个命门目就是命门，它所藏的先天之精就是脑心，如同中医的心肝脾肺肾五脏系统本身就包含了解剖学上的实质器官一样，《内经》的命门也是有解剖学物质基础的，因为没有脱离物质而独立存在的功能!
《内经》曰:“太阳根于至阴，结于命门。命门者，目也”。结：缔结之结也，即足太阳经是缔结于命门的一条经脉；结：植物长出的果实或植物结出的果实，即足太阳是命门长出的一条经脉或足太阳是结出于命门的一条经脉，所以说“太阳......结于命门”；结：系也，即足太阳是系于命门的一条经脉，如同命门为“元气之所系也”一样。
《内经》曰:“足太阳之脉，起于目内眦。”也是说足太阳是起于目睛命门的经脉。
足太阳之脉出自目睛命门就必源自脑心，这是目睛命门与脑心在发生学上的渊源关系所决定的。即足太阳之脉是起源于目睛命门脑心的经脉，它属于目睛命门，这是《内经》所明确的。
元气就是“大盛之阳气”，而足太阳经是运行大盛之阳气的经脉，所以足太阳就是运行命门元阳之气的经脉，二者是脏经相符的渊源关系，这应是《内经》其脏配其经的本意。
命门脑心元精化生的元气随起源于脑心生命之室的足太阳经的运行通过目系出生命之门目（天）即“气出于脑”“阳气出于目......循项下足太阳”，然后上额循项下入五脏六腑之俞以温煦人体内的地（五脏），这就是命门天之阳气下降于地的经络学证据。
第302章 命门
五脏得到命门天阳之气的温煦后，便产生五脏地之阴气以上升于天，但五脏地之阴气如何上升于命门？
其途径有二：一、《内经》曰:“五脏六腑之精气皆上注于目......上属于脑”，目与脑心在发生学上有着渊源关系，上注于目睛命门就必抵达于脑心，所以五脏六腑之精气（地之阴气）皆上升于目睛命门脑心（天）。
五脏六腑之精气是如何上升于目睛命门上属于脑心的？
《内经》有“诸脉者，皆属于目”和“目者，宗脉之所聚”之说，“诸、宗”的字义是“众、许多”的意思，即五脏六腑之精气应是通过“诸脉、宗脉”等众多经脉上升于目睛命门的，然后再通过目系上属于脑心，以地阴之气上济于天。
二、《内经》曰：“肾生骨髓”。肾精主骨生髓通于脑。《内经》又曰“肾者主水，受五脏六腑之精而藏之”。
由于肾是五脏之阴的根本，所以是肾藏五脏六腑之精，即肾精携带着五脏六腑之精气（地之阴气）通过髓道抵达它的最高点——脑心命门，或者说肾水之精气通过髓道上升至它的顶点——脑心。
《经》中有曰：足少阴“贯脊，属肾”。《灸经》曰：足少阴脉“循脊内”，足少阴肾经与脊髓直接相通，即肾或是通过其上循脊内的足少阴肾经经过脊髓（髓道）上升至它的最高点——脑心命门。
脑髓有脑心与大脑先后天之分，脑心的主要内容是丘脑。大脑是丘脑的自然延伸部分，是脑的低级部位，丘脑是脑的高级部位。
无论从形态解剖学还是从生理学观点看，脑心应是髓道的最高点，肾主骨生髓通于脑的最高点应是脑心，足少阴肾经上循脊内的顶点应是脑心。
如此命门居于人体的上极以其天火之阳气下降于地，温煦而不燔灼，蒸化而不干戈，气化适宜则水之阴气由此而化而升；肾居于人体的下极以其地水之阴气上升于天，相济而不凌盛，奉养而不扼息，濡养有度则火之阳气由此而生而降。
此阴升阳降水火相济就是太极阴阳图阴阳相互为用的升降运动。这也是命门“其气与肾通”的本意。
《内经》曰：“气之升降，天地之更用也......升已而降，降者谓天；降已而升，升者谓地。
天气下降，气流于地，地气上升，气腾于天。故高下相召，升降相因，而变作矣”。
命门大盛之阳气通过足太阳经的运行入十二脏之俞下降于五脏六腑，降者谓天，所以命门是人体内的天；五脏六腑之精气通过诸脉、宗脉皆上升于目睛命门上属于脑心，升者谓地，所以五脏是人体内的地。
命门足太阳经大盛之阳气下降于五脏六腑，五脏六腑门足太阳经下降于五脏六腑之俞，并唯肾而络，肾精主骨生髓直通于命门脑心，这就是“水能升而火能降，一升一降，无有穷已，故生意存焉”的天人相应观。
命门天之阳气与五脏地之阴气相互为用的升降运动将命门与五脏有机地联系在一起，使人体成为一个对立统一的之精气（阴气）皆上升于目睛命门，这就是“气之升降，天地之更用也”的天人相应观。命整体，所以“人身小天地”“人是小乾坤”。
从整体看，命门阳中有阴，五脏阴中有阳就是太极阴阳图阴阳互根的结构模式；命门天之阳气下降于五脏，五脏地之阴气上升于命门就是太极阴阳图阴阳互用的运动模式。前者是结构，为体，后者是功能，为用，符合任何一个事物都有结构（体）与功能（用）的两个方面，也符合太极阴阳图的两大特征。
命门与五脏高下相召，升降相因，而生机不息，这就是《内经》的“天人合一”之道。
人们指出：“五脏之本，本之命门，神气之本，本在元精”。
五脏与命门是对立统一的天地阴阳关系，而阴以阳为主，地以天为主，所以“五脏之本，本在命门”，如同地球之本，本在太阳一样，没有太阳就没有地球。
命门元精化生元气，元气化生元神，所以命门元神元气之“神气之本，本在元精”，如同太阳的阳气神明之本，本在太阳的核心区一样，没有元精就没有神气。
可见人们早已精辟的阐述了命门与五脏的关系，只是没有上升到对立统一的天地阴阳关系。